分公司申请商标归总公司吗

分公司不具有法人资格，其持有的商标并不属于分公司所有，而是由总公司持有，所以分公司撤销不影响商标的所有权。

而总公司如果被撤销，企业（包含分公司）则需进行清算，商标可以进行转让、出售、变卖，如果不作处理商标所有权会随着企业的清算、撤销而消失。

法律分析：以公司名义注册的商标当然是归公司所有的，如果是股东个人注册的商标的话，商标权是归股东所有的，公司想要使用股东的商标，需要签订商标权转让协议。归公司享有的商标权、知识产权等，股东个人是没有权利随便使用的。

法律依据：《中华人民共和国商标法》第六十二条 县级以上工商行政管理部门根据已经取得的违法嫌疑证据或者举报，对涉嫌侵犯他人注册商标专用权的行为进行查处时，可以行使下列职权：（一）询问有关当事人，调查与侵犯他人注册商标专用权有关的情况；（二）查阅、复制当事人与侵权活动有关的合同、发票、账簿以及其他有关资料；（三）对当事人涉嫌从事侵犯他人注册商标专用权活动的场所实施现场检查；（四）检查与侵权活动有关的物品；对有证据证明是侵犯他人注册商标专用权的物品，可以查封或者扣押。工商行政管理部门依法行使前款规定的职权时，当事人应当予以协助、配合，不得拒绝、阻挠。在查处商标侵权案件过程中，对商标权属存在争议或者权利人同时向人民法院提起商标侵权诉讼的，工商行政管理部门可以中止案件的查处。中止原因消除后，应当恢复或者终结案件查处程序。

可以共同拥有商标,或者假设商标持有人是总公司,可以许可分公司使用,叫许可、授权使用。